子栏目: rna提取试剂盒
  • RNA-seq数据分析文献28 - 斑马鱼-4.011

    RNA-seq数据分析文献28 - 斑马鱼-4.011

    导读 思路:实验前处理--RNA-seq--lncRNA鉴定与差异lncRNA分析--差异基因分析--功能富集;图表:实验处理结果图、RNA-seq质控图、Venn图、基因富集图、差异基因热图;验证实验表、差异lncRNA表; 摘要 本文是一篇lncRNA样品的RNA-seq数据分析文章,作者希望从RNA-seq数据中研究参与SVCV感染的lncRNA及下游基因。 前言 背景部分介绍了本研究的实验对象斑马鱼突变株rag1。 方法 实验材料和测序
  • 小鼠口腔菌群促使口腔鳞状细胞癌(OSCC)的恶化

    小鼠口腔菌群促使口腔鳞状细胞癌(OSCC)的恶化

    口腔鳞状细胞癌(OSCC)是头颈部最常见的恶性肿瘤。根据16SrRNA基因测序和宏转录组学分析,我们研究了在4-硝基喹啉-1-氧化物(4-NQO)诱导的OSCC模型小鼠中,口腔菌群组成及其功能的变化特征。 与健康小鼠相比,肿瘤组小鼠口腔菌群多样性总体增加。Parabacteroides丰度在健康小鼠中低于肿瘤组,Corynebacterium的结果与之相反。宏转录组学分析结果揭示了菌群中一些相关代谢通路的过
  • TCGA多肿瘤mRNA, lncRNA, miRNA数据挖掘

    TCGA多肿瘤mRNA, lncRNA, miRNA数据挖掘

    对于大多数常见疾病,GEO或TCGA等数据库有许多可用的原始数据,我们在寻找一个重要的mRNA/lncRNA/miRNA/circRNA进行研究,或者自己高通量测序找到一部分基因,需要扩大样品验证该基因差异的可靠性,我们可以借助于已有数据。之前我们推送过乳腺癌的数据分析TCGA乳腺癌mRNA,lncRNA,miRNA数据挖掘,肝癌的数据分析TCGA肝癌mRNA,lncRNA,miRNA数据挖掘,肺腺癌的数据分析TCGA肺腺癌mRNA,lncRNA,miR
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  • 小鼠口腔菌群促使口腔鳞状细胞癌(OSCC)的恶化
    口腔鳞状细胞癌(OSCC)是头颈部最常见的恶性肿瘤。根据16SrRNA基因测序和宏转录组学分析,我们研究了在4-硝基喹啉-1-氧化物(4-NQO)诱导的OSCC模型小鼠中,口腔菌群组成及其功能的变化特征。 与健康小鼠相比,肿瘤组小鼠口腔菌群多样性总体增加。Parabacteroides丰度在健康小鼠中低于肿瘤组,Corynebacterium的结果与之相反。宏转录组学分析结果揭示了菌群中一些相关代谢通路的过表达,表明口腔细菌的某些特定生理活动对OSCC的发生和发展至关重要。 材料与方法 实验设计 采用4-...
  • RNA-seq数据分析文献28 - 斑马鱼-4.011
    导读 思路:实验前处理--RNA-seq--lncRNA鉴定与差异lncRNA分析--差异基因分析--功能富集;图表:实验处理结果图、RNA-seq质控图、Venn图、基因富集图、差异基因热图;验证实验表、差异lncRNA表; 摘要 本文是一篇lncRNA样品的RNA-seq数据分析文章,作者希望从RNA-seq数据中研究参与SVCV感染的lncRNA及下游基因。 前言 背景部分介绍了本研究的实验对象斑马鱼突变株rag1。 方法 实验材料和测序 本部分介绍RNA测序前处理过程。 序列装配和lnc RNA ...
  • TCGA多肿瘤mRNA, lncRNA, miRNA数据挖掘
    对于大多数常见疾病,GEO或TCGA等数据库有许多可用的原始数据,我们在寻找一个重要的mRNA/lncRNA/miRNA/circRNA进行研究,或者自己高通量测序找到一部分基因,需要扩大样品验证该基因差异的可靠性,我们可以借助于已有数据。之前我们推送过乳腺癌的数据分析TCGA乳腺癌mRNA,lncRNA,miRNA数据挖掘,肝癌的数据分析TCGA肝癌mRNA,lncRNA,miRNA数据挖掘,肺腺癌的数据分析TCGA肺腺癌mRNA,lncRNA,miRNA数据挖掘受到广大老师的喜爱,本文我们整理了TCG...